En articulación con el sistema educativo colombiano, la implementación de los proyectos pedagógicos transversales y de enseñanza obligatoria en la Institución Educativa Comfasucre responde al mandato constitucional y legal de garantizar una formación integral que trascienda la fragmentación disciplinar.
Fundamentados en el artículo 14 de la Ley 115 de 1994 (modificado por la Ley 1029 de 2006) y reglamentados por el artículo 36 del Decreto 1860 de 1994 — compilado en el Decreto Único Reglamentario 1075 de 2015 —, estos proyectos constituyen estrategias de planificación y acción curricular que articulan las distintas áreas del conocimiento con la realidad social, cultural, económica y ambiental del entorno. Lejos de operar como asignaturas independientes o actividades aisladas, estas iniciativas se integran de manera orgánica al Proyecto Educativo Institucional (PEI) y al plan de estudios en todos los niveles educativos que ofrece el colegio, fortaleciéndose mediante normativas específicas como la Ley 1549 de 2012 (educación ambiental), la Ley 1620 de 2013 (convivencia escolar y derechos humanos) y la Ley 1503 de 2011 (movilidad segura).
De este modo, la Institución Educativa Comfasucre asume estos ejes como herramientas dinamizadoras para el desarrollo de competencias ciudadanas, el pensamiento crítico y la transformación de problemáticas cotidianas de la comunidad educativa, por lo cual se implementan los siguientes proyectos:
| Proyecto | Equipo Responsable | Tipo de proyecto |
| Educación y seguridad Vial | Arte y Cultura | Transversal obligatorio |
| Aprovechamiento del tiempo libre y ocio | Educación Inicial | Transversal obligatorio |
| Educación Sexual y construcción de ciudadanía PESCC | Naturales | Transversal obligatorio |
| Educación Económica y Financiera | Matemáticas | Transversal obligatorio |
| DDHH- Derechos humanos | Sociales | Transversal obligatorio |
| PRAE – Educación ambiental | Naturales | Transversal obligatorio |
| Hábitos y Estilo de vida saludable | Recreación y Deporte | Institucional |
| Escuela de padres | Equipo directivo | Institucional |
| Orientación Vocacional | Bienestar | Institucional |
| P y P salud y primeros auxilios | Enfermería | Institucional |
| Equilibradamente | Bienestar | Institucional |
| Matemáticas divertidas | Matemáticas | Institucional |
| Proyecto de lectura, Escritura y Oralidad – “La magia de Leer” | Castellano | Institucional |